奕谱生物全癌标志物早检技术被《肿瘤DNA甲基化标志物检测及临床应用专家共识》(2024版)权威推荐

《肿瘤DNA甲基化标志物检测及临床应用专家共识》发布会现场

 

2024年4月20日,由中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会甲基化标志物专家委员会历经半年时间从大纲撰写、初稿撰写、交叉审稿、初稿修订、编辑部审稿、共识投票等程序凝结而成的《肿瘤DNA甲基化标志物检测及临床应用专家共识》(下简称“共识”)2024CCTB中国肿瘤标志物学术大会肿瘤甲基化标志物论坛隆重举行共识发布会,来自全国各地的多位肿瘤领域的专家同道云集一堂,共同见证此次共识的发布。《共识》发布会的圆满举行,标志着这一汇聚最新循证医学证据和专家智慧的临床指导性文件正式走进中国实践,谱写肿瘤DNA甲基化标志物检测及临床应用的全新篇章!其中,上海奕谱生物科技有限公司(以下简称“奕谱生物”)系列全癌标志物及甲基化创新检测方案纳入《肿瘤DNA甲基化标志物检测及临床应用专家共识》,应用导航定位测序(guide positioning sequencing,GPS)技术筛选到的PCDHGB7、HIST1H4F、SIX6 基因和基于全癌标志物的Epiprobe TAGMe系列检测产品成为本专家共识的璀璨亮点。

 

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《共识》编写专家组组长复旦大学于文强教授

 

中国抗癌协会肿瘤标志物专业委员会为了推动DNA甲基化标志物在肿瘤管理中的应用,提高临床医技人员及科研人员对其重要性的认识,同时规范检测流程,确保检测结果的准确性和可靠性,组织检验、病理、临床与基础科学在DNA甲基化领域内的专家学者,共同编写了《肿瘤DNA甲基化标志物检测及临床应用专家共识》。旨在为临床医生、研究人员及检测人员提供一套关于DNA甲基化标志物检测及其临床应用的指导性建议,促进该领域的标准化发展,优化个性化肿瘤诊疗策略,为患者的早筛早诊以及精准诊疗提供决策依据。本次《共识》正式发布是一个划时代的重要时刻,具有里程碑式的意义,共识凝聚了几十位专家的智慧和心血,经过大量的文献查阅和资料收集,反复探讨和修改最终成文定稿并正式见刊。该共识于2024年4月19日在《中国癌症防治杂志》(2024年04月第16卷第2期)发表,希望共识的发表能为临床肿瘤防治实践提供有力武器。

 

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《共识》发布会现场:2024CCTB肿瘤甲基化标志物论坛主席

 

肿瘤筛查场景中,共识分别提到了DNA甲基化标志物在单癌种筛查和多癌种筛查中的应用。DNA甲基化标志物在单癌种筛查中的应用——DNA甲基化技术为肿瘤早筛提供了一种高效、非侵入性且具有广泛应用潜力的筛查方法,实现了对宫颈癌等的早诊早筛。DNA甲基化技术也可以应用于宫颈癌筛查的高危分流,能对人乳头瘤病毒(HPV)阳性患者进行初步分流。上海交通大学附属国际和平妇幼保健院团队建立了纳入3251例hrHPV阳性女性的前瞻性研究队列,对HPV检查的剩余样本进行PCDHGB7基因甲基化检测,与细胞学检测相比,PCDHGB7 甲基化检测减少了62.2%的非16/18型高危hrHPV阳性女性的转诊,显示出更为优越的特异度(92.1% vs 74.9%)。DNA甲基化标志物在多癌种筛查中的运用——基于全癌标志物策略的多癌种筛查应用应用导航定位测序(guide positioning sequencing,GPS)技术,通过对全基因组DNA高精度和高覆盖度的甲基化位点进行筛查,于文强团队挖掘了基于DNA甲基化位点的全癌标志物,这类DNA甲基化标志物可用于多种癌症的筛查,其中通过全基因组DNA甲基化数据挖掘的HIST1H4F基因在17种癌症中呈异常高甲基化。奕谱生物团队筛选的全癌标志物PCDHGB7 在不仅在TCGA数据库的17种癌症类型中都呈高甲基化,后续还在13种临床肿瘤样本中得到验证。SIX6 基因在10种常见癌症类型的 678 份临床样本表现出普遍的高甲基化,其中,SIX6 基因高甲基化诊断宫颈癌子宫内膜癌尿路上皮癌的ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.99、0.94及0.93,表明SIX6 高甲基化是肿瘤进展的早期事件,可以应用于肿瘤的临床早期筛查。

肿瘤辅助诊断场景中,共识提到了DNA甲基化标志物用于脱落细胞学检测的应用。妇科应用中以宫颈脱落细胞进行DNA甲基化检测,首次提出子宫颈癌和子宫内膜癌筛检临床路径。脱落细胞甲基化标志物用于女性生殖道肿瘤的临床诊断:女性生殖道内腔的通畅性让刷取宫颈脱落细胞进行无创分子检测子宫颈癌、子宫内膜癌成为可能。上海交通大学附属国际和平妇幼保健院团队对宫颈脱落细胞学检查的剩余样本进行PCDHGB7 基因甲基化检测,PCDHGB7 检测≥宫颈高级别鳞状上皮内瘤变的敏感性和特异性分别为82.1%和88.7%,检测宫颈癌的AUC为0.97。中国大型临床研究使用PCDHGB7 甲基化进行高危型HPV阳性女性的分层管理,诊断的敏感性为82.4%,特异性为91.1%。国内外研究与专家建议,推荐子宫颈癌DNA甲基化筛检临床路径:(1)HPV阳性高风险或细胞学异常女性的分层管理;(2)宫颈Ⅲ型转化区与潜在腺癌病人风险评估;(3)病变(癌)治疗后监测;(4)退出宫颈癌筛查计划的评估。

40%~50%的子宫内膜癌患者的宫颈脱落细胞可检测到子宫内膜癌细胞,这让使用脱落细胞进行内膜癌甲基化早期诊断具临床可行性。通过宫颈口脱落细胞检测子宫内膜癌,PCDHGB7 甲基化对早期(Ⅰ期)子宫内膜癌诊断的敏感性为85.71%,特异性为80.60%,目前基于该基因的检测产品已获得欧盟CE认证。国内外研究与专家建议,推荐子宫内膜癌DNA甲基化筛检临床路径:⑴影像学联合甲基化筛检;⑵生殖道出血分层管理;⑶子宫内膜癌高风险人群筛查。

脱落细胞DNA甲基化检测是一种新型的、便捷的、无创的辅助癌症早筛早诊工具。脱落细胞甲基化标志物用于膀胱癌的辅助诊断:一些基于尿液脱落细胞DNA甲基化检测早期膀胱癌的产品被FDA/CE批准上市,如TAGMe(Epiprobe,Shanghai,China)TAGMe检测尿液中SIX6甲基化的状态,其诊断尿路上皮癌的敏感性为86.67%,特异性为90.80%,该产品(“TAGMe DNA Methylation Detection Kit (qPCR) for Urothelial Cancer” | 滂奕清®)已获欧盟CE认证,并于2023年获得FDA的“突破性医疗器械认定”脱落细胞甲基化标志物用于肺癌的辅助诊断:通过检测肺泡灌洗液样本中的HIST1H4F 甲基化水平诊断肺癌,其特异性为96.7%,敏感性为87.0%,其中针对Ⅰ~Ⅱ期肺癌的敏感性为82.6%~84.5%。奕谱生物团队构建基于胸水脱落细胞的PCDHGB7 甲基化诊断模型,判断肺癌是否出现胸膜转移的敏感性为94.21%。

此外,共识还提到:1)肿瘤溯源是肿瘤临床诊疗的重要工作,可为肿瘤精准治疗提供依据。有别于传统溯源方法,基于组织标本或cfDNA的DNA甲基化检测在肿瘤溯源领域展示出良好的应用前景;2)基于ctDNA甲基化标志物的MRD分析不需要对肿瘤组织进行测序以获得原发肿瘤的特征性突变信息,并且不受克隆造血导致的突变干扰,可用于结直肠癌和乳腺癌患者术后或其他治疗完全缓解后的MRD检测,有望成为肿瘤患者预后风险管理的关键工具;3)DNA甲基化标志物可用于评估肝癌、结直肠癌及前列腺癌等肿瘤进展及复发的动态监测,优化患者风险分层及治疗措施,常规复发监测标志物与DNA甲基化预测模型相结合可进一步提升预测效能。
癌症是全球死亡的主要原因之一,对癌症的“早发现、早诊断、早治疗”可以降低所有类型癌症的死亡率。未来,奕谱生物期待和共识“医”路共前行,
持续拓展应用场景,将基于全癌标志物的肿瘤DNA甲基化标志物检测产品和服务进一步落地和实践,为大众健康保驾护航,为医学领域发展贡献更多的智慧和力量。

《共识》发布会大咖齐聚,共同见证!

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